Struktur Kelembagaan dan Tata Kerja Lembaga Penelitian Universitas Pattimura mengacu pada Kep. MENDIKBUD No. 0170/O/1995. Secara struktural, susunan kelembagaan LPPM Unpatti dapat dilihat pada gambar berikut, yakni:

Struktur Kelembagaan LPPM UNPATTI